超声波在启用时会让液体内部出现空化现象，溶解在其中的空气因负压而出现过饱和的现象，它们从液体中逸出时会形成微小的气泡。这些小气泡会随着周围介质的震动不断的运动、震荡、生长、收缩及破裂。而它们在破裂的瞬间会产生局部高温高压和高速冲击流，虽然受到冲击的范围极小，但是在众多小气泡的共同作用下，它还是能对果蔬进行物理清洗并消毒杀菌。经过测试，当超声波的功率为1千瓦时，只需要15分钟就能达到良好的去除农药的效果，但是果蔬的表面会出现破损现象。

臭氧是一种具有强氧化性的淡蓝色气体，它常用于杀菌消毒、防止发霉、除臭等，在生产和生活中的应用较为广泛。臭氧能与果蔬中的有机磷或氨基甲酯类等农药发生化学反应，即通过化学的方法去除残留。由于发生化学反应需要一定的时间，因此处理的时间越久，降解的效果也会越好。经过测试，经过30分钟的处理后，果蔬中农药的降解率能达到50%以上。虽然有一定的效果，但是远不如超声波处理的效果好。